Успіхи у наукових пошуках та наполеглива праця В. І. Тимофієнка як співробітника одного з провідних науково-дослідних інститутів країни не залишилися непоміченими. У 1979 р. за пропозицією академіка АН УРСР Петра Тимофійовича Тронька (1915–2011) він давзгоду на переведення у Відділ історико-краєзнавчих досліджень Інституту історії України.